De nouvelles recherches indiquent que le marché de Wuhan est l’origine de la pandémie – New York Times

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Les scientifiques ont publié un paire de vaste études samedi qui pointent vers un marché de Wuhan, en Chine, comme origine de la pandémie de coronavirus. En analysant les données de diverses sources, ils ont conclu que le coronavirus était très probablement présent chez les mammifères vivants vendus sur le marché de gros des fruits de mer de Huanan fin 2019 et ont suggéré que le virus s’était propagé à deux reprises aux personnes qui y travaillaient ou y faisaient leurs courses. Ils ont dit qu’ils n’avaient trouvé aucun support pour une théorie alternative selon laquelle le coronavirus s’est échappé d’un laboratoire à Wuhan.





Des membres de l’équipe d’intervention d’urgence en matière d’hygiène de Wuhan quittant le marché de gros fermé des fruits de mer de Huanan le 11 janvier 2020.




Noël Celis/Agence France-Presse

« Lorsque vous regardez toutes les preuves ensemble, c’est une image extraordinairement claire que la pandémie a commencé sur le marché de Huanan », a déclaré Michel Worobeybiologiste de l’évolution à l’Université de l’Arizona et co-auteur des deux études.

Les deux rapports n’ont pas encore été publiés dans une revue scientifique qui nécessiterait un examen par les pairs.

Ensemble, ils représentent une salve importante dans le débat sur les débuts d’une pandémie qui a tué près de 6 millions de personnes dans le monde et rendu malade plus de 400 millions. La question de savoir si l’épidémie de coronavirus a commencé par un débordement d’animaux sauvages vendus sur le marché, une fuite d’un laboratoire de virologie de Wuhan ou d’une autre manière a donné lieu à des batailles géopolitiques rangées et à des débats sur la meilleure façon d’arrêter la prochaine pandémie.

Mais certains scientifiques extérieurs qui ont hésité à approuver l’hypothèse de l’origine du marché ont déclaré qu’ils n’étaient toujours pas convaincus. Jesse Bloom, virologue au Fred Hutchinson Cancer Research Center, a déclaré dans une interview qu’il restait une absence flagrante de preuves directes que les animaux du marché avaient eux-mêmes été infectés par le coronavirus.

« Je pense que ce qu’ils soutiennent pourrait être vrai », a déclaré le Dr Bloom à propos des nouvelles études. « Mais je ne pense pas que la qualité des données soit suffisante pour dire que l’un de ces scénarios est vrai avec confiance. »

Dans leur nouvelle étude, le Dr Worobey et ses collègues présentent des preuves que des mammifères sauvages qui auraient pu héberger le coronavirus étaient vendus en décembre 2019. Mais aucune faune n’était restée sur le marché au moment où les chercheurs chinois sont arrivés au début de 2020 pour prélever des échantillons génétiques. .



Photos d’animaux à vendre sur le marché de Huanan.



Animaux à vendre sur le marché de Huanan en 2019 et 2014, dont des chiens viverrins, des porcs-épics malais et un renard roux.




Source : Michael Worobey et al., préimpression via Zenodo. Photos prises par un citoyen et postées sur Weibo en 2019 (trois premières), et par Edward C. Holmes en 2014.

Les auteurs de la nouvelle étude comprennent des chercheurs qui ont déjà publié plus petit rapports qui avaient pointé vers une conclusion similaire, mais étaient basés sur beaucoup moins de détails. Leur analyse antérieure suggérait que le premier cas connu de coronavirus était un vendeur sur le marché de Huanan.

Dans une ligne de recherche distincte, des scientifiques du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies ont effectué une nouvelle analyse des traces génétiques de coronavirus collectées sur le marché en janvier 2020. Des études antérieures ont montré que les virus prélevés sur les premiers cas de Covid appartenaient à deux branches évolutives principales. Les échantillons du marché de Huanan comprenaient les deux branches, ont rapporté les scientifiques dans une étude qu’ils posté en ligne vendredi.

Le Dr Worobey, qui a déclaré qu’il n’était pas au courant de l’étude jusqu’à ce qu’elle soit rendue publique, a déclaré que leurs conclusions sont cohérentes avec le scénario que lui et ses collègues ont proposé pour deux origines sur le marché.

« La beauté de tout cela est de savoir à quel point tout s’additionne maintenant », a déclaré Jeremy Kamil, virologue à la Louisiana State University Health Sciences, qui n’a pas participé à la nouvelle étude.



Carte de Wuhan montrant l’emplacement du marché de gros des fruits de mer de Huanan.




Huanan Fruits de mer

Marché de gros

Huanan Fruits de mer

Marché de gros


Le marché de gros des fruits de mer de Huanan était un premier objet de suspicion lorsque Covid a balayé Wuhan pour la première fois. Vers la fin décembre 2019, quelques personnes qui travaillaient au marché ont développé une mystérieuse forme de pneumonie. Le 30 décembre, les responsables de la santé publique ont demandé aux hôpitaux de signaler tout nouveau cas de pneumonie lié au marché.

Il est également devenu clair fin décembre qu’un nouveau coronavirus était à l’origine de la mystérieuse pneumonie. Les coronavirus ont une histoire troublante en Chine : en 2002, un autre coronavirus a déclenché l’épidémie de SRAS, qui a tué 774 personnes. Les scientifiques ont conclu plus tard que le virus provenait des chauves-souris, s’était propagé aux mammifères sauvages, puis s’était propagé aux humains sur les marchés où les mammifères étaient vendus.

Craignant une répétition du SRAS, les autorités chinoises ont ordonné la fermeture du marché de Huanan. La police de Wuhan l’a fermé le 1er janvier 2020. Des travailleurs vêtus de combinaisons de matières dangereuses ont lavé et désinfecté les étals.





Un membre de l’équipe d’intervention d’urgence en matière d’hygiène de Wuhan à l’intérieur du marché fermé de Huanan le 11 janvier 2020.




Noël Celis/Agence France-Presse

Des scientifiques chinois ont déclaré avoir trouvé le virus dans des dizaines d’échantillons prélevés sur des surfaces et des égouts sur le marché, mais pas dans des écouvillons prélevés sur des animaux sur le marché.

Le lien avec le marché a semblé s’affaiblir à mesure que le coronavirus se propageait. Pendant ce temps, des questions se sont posées sur les recherches menées dans un laboratoire de la ville, l’Institut de virologie de Wuhan, où les scientifiques ont étudié les coronavirus.

Pour les nouvelles études, le Dr Worobey et ses collègues ont estimé la latitude et la longitude de 156 cas de Covid à Wuhan en décembre 2019. La plus forte densité de cas s’est concentrée autour du marché.



Analyse spatiale des cas de Covid en décembre 2019.





Huanan Fruits de mer

Marché de gros

Concentration des cas de Covid en Déc. 2019

Huanan Fruits de mer

Marché de gros

Concentration des cas de Covid en Déc. 2019





Source : Michael Worobey et al., préimpression via Zenodo



Le New York Times

Les chercheurs ont ensuite cartographié les cas en janvier et février. Ils ont utilisé Les données recueillies par des chercheurs chinois de Weibo, une application de médias sociaux qui a créé un canal permettant aux personnes atteintes de Covid de demander de l’aide. Les 737 cas tirés de Weibo étaient concentrés loin du marché, dans d’autres parties du centre de Wuhan avec une forte population de résidents âgés.



Analyse spatiale des cas de Covid en janvier-février 2020.





Huanan Fruits de mer

Marché de gros

Concentration des cas de Covid en janv.–fév. 2020

Huanan Fruits de mer

Marché de gros

Concentration des cas de Covid en janv.–fév. 2020





Source : Michael Worobey et al.



Le New York Times

Les modèles ont indiqué que le marché était à l’origine de l’épidémie, selon les études, le coronavirus se propageant ensuite dans les quartiers environnants avant de se déplacer plus loin dans la ville. Les chercheurs ont effectué des tests qui ont montré qu’il était extrêmement improbable qu’un tel motif puisse être produit simplement par hasard.

« C’est une preuve statistique très solide que ce n’est pas une coïncidence », a déclaré le Dr Worobey.

Les chercheurs ont également présenté des preuves qu’à la fin de 2019, les vendeurs du marché vendaient des chiens viverrins et d’autres mammifères connus pour être des hôtes potentiels de coronavirus. Des échantillons génétiques prélevés sur les sols, les murs et d’autres surfaces du marché de Huanan en janvier 2020 révèlent des traces de SARS-CoV-2 dans le coin sud-ouest du marché, où les vendeurs étaient regroupés.



Le marché de gros des fruits de mer de Huanan à Wuhan, en Chine.





Huanan Fruits de mer

Marché de gros

côté ouest

Huanan Fruits de mer

Marché de gros

côté ouest

Huanan Fruits de mer

Marché de gros

côté ouest




Schéma du marché de Huanan.





Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Coronavirus trouvé dans une étable

Stand de vente de mammifères vivants

Étal vendant de la viande inconnue

Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Coronavirus trouvé dans une étable

Stand de vente de mammifères vivants

Étal vendant de la viande inconnue

Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Étal où le coronavirus a été trouvé

Stand de vente de mammifères vivants

Étal vendant de la viande inconnue




Distribution d’échantillons de coronavirus sur le marché de Huanan.





Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Distribution des échantillons de coronavirus positifs

sur le marché

Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Distribution des échantillons de coronavirus positifs

sur le marché

Marché de gros des fruits de mer de Huanan

côté ouest

Distribution des échantillons de coronavirus positifs

sur le marché





Source : Michael Worobey et al.



Le New York Times; Image satellite via Google Maps

D’autres indices sont apparus lorsque les chercheurs ont créé un arbre généalogique évolutif des coronavirus échantillonnés au cours des premières semaines de la pandémie. L’arbre est divisé en deux branches principales, appelées A et B. En examinant les mutations dans chaque branche, les chercheurs ont conclu qu’elles devaient provenir d’animaux séparément, chacune s’adaptant à l’homme par elle-même.

La lignée B est probablement passée aux humains fin novembre ou début décembre 2019, estiment les chercheurs, tandis que la lignée A a sauté quelques semaines après cela.

Des études antérieures n’avaient identifié la lignée B que sur le marché de Huanan. Mais le Dr Worobey et ses collègues ont découvert que les deux premiers cas de lignée A ont été trouvés chez des personnes qui vivaient près du marché.

L’étude chinoise du CDC publiée vendredi a révélé un coronavirus de lignée A sur un gant collecté lors de la fermeture du marché. Cette découverte soutient l’hypothèse selon laquelle les deux coronavirus ont fait le saut des animaux sur le marché.





Des travailleurs en tenue de protection désinfectent le marché de Huanan le 4 mars 2020.




Reuter

Le Dr Bloom, cependant, a remis en question l’idée qu’il y avait eu deux retombées distinctes. Il a noté que l’échantillon de la lignée A du marché a été collecté quelque temps après que le virus a commencé à se propager chez l’homme, ce qui soulève la possibilité qu’il ait été introduit sur le marché.

Il a dit que les deux lignées différaient également par seulement deux mutations, et que l’une aurait pu évoluer à partir de l’autre lorsque le virus était transmis d’une personne à l’autre.

« Je ne suis particulièrement pas convaincu par la conclusion qu’il doit nécessairement y avoir eu deux retombées différentes sur le marché des fruits de mer de Huanan », a déclaré le Dr Bloom.

Les nouvelles études ne précisent pas exactement quels animaux propagent le coronavirus sur le marché de Huanan. Mais le Dr Worobey et ses collègues ont déclaré qu’il pourrait être possible d’approfondir le mystère en analysant les données génétiques recueillies par des chercheurs chinois. En plus des gènes viraux, il pourrait également inclure des gènes des mammifères qui les ont portés.

Cet article est apparu en premier (en Anglais) sur https://www.nytimes.com/interactive/2022/02/26/science/covid-virus-wuhan-origins.html

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